- lab1.ipynb
Целью лабораторной работы является построение эмпирической функции дожития, условной функции дожития (при условии дожития до момента t, где t возможно задать в качестве параметра), гистограммы по экспериментальным данным, а также аппроксимации эмпирической функции дожития кривой дожития Гомперца. Оценку параметров кривой Гомперца при аппроксимации можно производить любым методом (методом максимального правдоподобия, методом наименьших квадратов). В качестве экспериментальных данных берется выборка моментов гибели (измеряется в днях) лабораторных животных при различных биологических экспериментах - life_expectancy.txt
Результатом лабораторной работы № 1 является компьютерная программа,которая выводит в графическом режиме эмпирическую функцию дожития, условную функцию дожития (на произвольно заданный момент) и гистограмму по предложенным экспериментальным данным, а также оценивает параметры аппроксимирующей кривой Гомперца и строит данную кривую.
Нелинейная минимизация метода наименьших квадратов и подбор кривых для Python: https://lmfit.github.io/lmfit-py/ Установка pip install lmfit
Installation: pip install lifelines or conda install -c conda-forge lifelines
Introduction to survival analysis https://lifelines.readthedocs.io/en/latest/Survival%20Analysis%20intro.html
https://kpfu.ru/portal/docs/F_1675497345/lekciya.9.pdf
Условная функция дожития (conditional_after, lifelines) https://lifelines.readthedocs.io/en/latest/Survival%20Regression.html
- lab2.ipynb
Целью работы является применение критериев Стьюдента и Фишера для проверки гипотез о статистической значимости различий между группами наблюдаемых индивидуумов.
В первой части работы необходимо с помощью критерия Стьюдента проверить гипотезу о равенстве средних значений (случайности различий) двух нормально распределенных совокупностей. В качестве экспериментальных данных берутся две выборки моментов гибели (измеряется в днях) лабораторных животных при различных биологических экспериментах.
Во второй части работы необходимо с помощью критерия Фишера проверить гипотезу о равенстве дисперсий (случайности различий) четырех нормально распределенных совокупностей. В качестве экспериментальных данных берутся четыре выборки моментов гибели (измеряется в днях) лабораторных животных при различных биологических экспериментах. Уровень значимости критериев в обоих случаях взять α=0.05.
Результатом лабораторной работы № 2 является компьютерная программа, написанная на языке программирования высокого уровня (или в статистическом пакете) или таблицы, сформированные в Exel, которые содержат исходные данные и этапы проверки гипотез (промежуточные расчеты, критические значения соответствующих распределений), а также приводят конечные результаты (основная гипотеза верна или нет).
- lab3.ipynb
Целью работы является применение непараметрических критериев - критерия знаков и критерия Вилкоксона - для проверки гипотез о статистической значимости различий между группами наблюдаемых индивидуумов.
В первой части работы необходимо с помощью критерия знаков проверить гипотезу о статистической значимости различий двух совокупностей. В качестве экспериментальных данных берутся две выборки моментов гибели (измеряется в днях) лабораторных животных при различных биологических экспериментах. Так как для применения критерия знаков необходимо чтобы обе выборки были одинакового объема, то из каждого файла берутся М значений, где М – минимальное количество элементов в двух файлах.
Во второй части работы необходимо применить ранговый критерий Вилкоксона для проверки гипотезы о статистической значимости различий двух совокупностей. В качестве экспериментальных данных берутся две выборки моментов гибели (измеряется в днях) лабораторных животных при различных биологических экспериментах. Уровень значимости критериев во всех случаях взять α=0.05.
Результатом лабораторной работы №3 является компьютерная программа, написанная на языке программирования высокого уровня (или в статистическом пакете) или таблицы, сформированные в Exel, которые содержат исходные данные и этапы проверки гипотез (промежуточные расчеты, критические значения соответствующих распределений), а также приводят конечные результаты (основная гипотеза верна или нет).