v10.0.0

microbiomedata · Jan 23, 2024 · 9211a67 · 9211a67
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diff --git a/examples/output/Biosample-embargoed.json b/examples/output/Biosample-embargoed.json
@@ -0,0 +1,26 @@
+{
+  "id": "nmdc:bsm-99-dtTMNb",
+  "part_of": [
+    "nmdc:sty-00-abc123"
+  ],
+  "env_broad_scale": {
+    "has_raw_value": "ENVO:00002030",
+    "term": {
+      "id": "ENVO:00002030"
+    }
+  },
+  "env_local_scale": {
+    "has_raw_value": "ENVO:00002169",
+    "term": {
+      "id": "ENVO:00002169"
+    }
+  },
+  "env_medium": {
+    "has_raw_value": "ENVO:00005792",
+    "term": {
+      "id": "ENVO:00005792"
+    }
+  },
+  "embargoed": true,
+  "@type": "Biosample"
+}
diff --git a/examples/output/Biosample-embargoed.ttl b/examples/output/Biosample-embargoed.ttl
@@ -0,0 +1,25 @@
+@prefix ENVO: <http://purl.obolibrary.org/obo/ENVO_> .
+@prefix MIXS: <https://w3id.org/mixs/> .
+@prefix dcterms: <http://purl.org/dc/terms/> .
+@prefix nmdc: <https://w3id.org/nmdc/> .
+@prefix xsd: <http://www.w3.org/2001/XMLSchema#> .
+
+nmdc:bsm-99-dtTMNb a nmdc:Biosample ;
+    dcterms:isPartOf nmdc:sty-00-abc123 ;
+    MIXS:0000012 [ a nmdc:ControlledIdentifiedTermValue ;
+            nmdc:has_raw_value "ENVO:00002030" ;
+            nmdc:term ENVO:00002030 ] ;
+    MIXS:0000013 [ a nmdc:ControlledIdentifiedTermValue ;
+            nmdc:has_raw_value "ENVO:00002169" ;
+            nmdc:term ENVO:00002169 ] ;
+    MIXS:0000014 [ a nmdc:ControlledIdentifiedTermValue ;
+            nmdc:has_raw_value "ENVO:00005792" ;
+            nmdc:term ENVO:00005792 ] ;
+    nmdc:embargoed true .
+
+ENVO:00002030 a nmdc:OntologyClass .
+
+ENVO:00002169 a nmdc:OntologyClass .
+
+ENVO:00005792 a nmdc:OntologyClass .
+
diff --git a/examples/output/Biosample-embargoed.yaml b/examples/output/Biosample-embargoed.yaml
@@ -0,0 +1,16 @@
+id: nmdc:bsm-99-dtTMNb
+part_of:
+- nmdc:sty-00-abc123
+env_broad_scale:
+  has_raw_value: ENVO:00002030
+  term:
+    id: ENVO:00002030
+env_local_scale:
+  has_raw_value: ENVO:00002169
+  term:
+    id: ENVO:00002169
+env_medium:
+  has_raw_value: ENVO:00005792
+  term:
+    id: ENVO:00005792
+embargoed: true