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imjiaoyuan/bioinformatics_toolbox

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Bioinformatics Toolbox

Bioinformatics Toolbox 是一个集成了多种生物信息学数据可视化工具的在线平台。该工具箱提供了直观的用户界面,支持多种常用的生物信息学数据可视化需求。

功能模块

  • 生物数据库导航: 提供核酸、蛋白质、基因组等12个分类的数据库资源导航,支持用户提交新数据库
  • 蛋白质结构可视化: 支持 PDB 和 CIF 格式的蛋白质结构在线可视化与分析
  • 进化树可视化: 支持 Newick 格式的系统发育树在线可视化与编辑
  • 热图可视化: 支持表达矩阵的热图绘制、聚类分析与数据标准化
  • 饼图可视化: 支持数据集的饼图绘制、颜色定制与图例编辑
  • SNP 密度图可视化: 支持基因组 SNP 分布密度的可视化与区域分析
  • 火山图可视化: 支持差异表达基因的火山图绘制与阈值调整

使用说明

本项目可通过两种方式使用:

  • 在线使用:直接访问 Bioinformatics Toolbox
  • 本地使用:如果在线访问速度较慢,可以下载项目压缩包在本地使用。每个工具模块都是独立的,可以单独下载使用。

开源协议

MIT License

联系方式

About

通过 HTML/CSS/js 来实现多种生物信息学可视化功能

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