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shinyServer(function(input, output, session) {
#datos covid ----
#descargar los datos de covid: https://github.com/datauc/api-covid19-datauc
#Producto 1: Casos totales por comuna incremental https://coronavirus-api.mat.uc.cl/casos_totales_comuna_incremental
casos_comuna_incremental <- reactive({
casos_comuna_incremental <- readr::read_csv("https://coronavirus-api.mat.uc.cl/casos_totales_comuna_incremental")
})
#Producto 19: Casos activos por fecha de inicio de síntomas y comuna https://coronavirus-api.mat.uc.cl/casos_activos_sintomas_comuna
casos_comuna_activos <- reactive({
casos_comuna_activos <- readr::read_csv("https://coronavirus-api.mat.uc.cl/casos_activos_sintomas_comuna")
})
#Producto 15: Casos nuevos por fecha de inicio de síntomas por comuna https://coronavirus-api.mat.uc.cl/casos_nuevos_sintomas_comuna
casos_comuna_nuevos <- reactive({
casos_comuna_nuevos <- readr::read_csv("https://coronavirus-api.mat.uc.cl/casos_nuevos_sintomas_comuna")
})
#texto de fechas ----
output$fecha_maxima_nuevos <- renderText({
paste(format(casos_comuna_nuevos() %>%
filter(!is.na(inicio_semana_epidemiologica)) %>%
filter(inicio_semana_epidemiologica != max(inicio_semana_epidemiologica)) %>%
filter(inicio_semana_epidemiologica == max(inicio_semana_epidemiologica)) %>%
select(fin_semana_epidemiologica) %>%
distinct() %>% pull(), "%d/%m/%Y"))
})
output$fecha_maxima_activos <- renderText({
paste(format(max(casos_comuna_activos()$fecha), "%d/%m/%Y"))
})
output$fecha_maxima_incremental <- renderText({
paste(format(max(casos_comuna_incremental()$fecha), "%d/%m/%Y"))
})
casen_datos_covid <- reactive({
covid_comuna_incremental <- casos_comuna_incremental() %>%
filter(region == "Metropolitana") %>%
filter(!is.na(casos)) %>%
filter(fecha == max(fecha)) %>%
select(comuna, fecha, casos) %>%
mutate(casos_comuna_incremental = as.numeric(casos)) %>%
select(-casos)
covid_comuna_activos <- casos_comuna_activos() %>%
filter(region == "Metropolitana") %>%
filter(!is.na(casos)) %>%
filter(!is.na(fecha)) %>%
filter(fecha == max(fecha)) %>%
select(comuna, casos) %>%
mutate(casos_comuna_activos = as.numeric(casos)) %>%
select(-casos)
covid_comuna_nuevos <- casos_comuna_nuevos() %>%
filter(region == "Metropolitana") %>%
filter(!is.na(casos)) %>%
filter(!is.na(inicio_semana_epidemiologica)) %>%
filter(inicio_semana_epidemiologica != max(inicio_semana_epidemiologica)) %>%
filter(inicio_semana_epidemiologica == max(inicio_semana_epidemiologica)) %>%
select(comuna, inicio_semana_epidemiologica, fin_semana_epidemiologica, semana_epidemiologica, casos) %>%
mutate(casos_comuna_nuevos = as.numeric(casos)) %>%
select(-casos)
#unir datos covid con datos casen
casen_datos_covid <- casen_datos %>%
mutate(comuna_match = iconv(tolower(comuna), from = 'UTF-8', to = 'ASCII//TRANSLIT')) %>%
left_join(covid_comuna_nuevos %>%
mutate(comuna_match = iconv(tolower(comuna), from = 'UTF-8', to = 'ASCII//TRANSLIT')) %>%
select(-comuna),
by = "comuna_match") %>%
left_join(covid_comuna_incremental %>%
mutate(comuna_match = iconv(tolower(comuna), from = 'UTF-8', to = 'ASCII//TRANSLIT')) %>%
select(-comuna),
by = "comuna_match") %>%
left_join(covid_comuna_activos %>%
mutate(comuna_match = iconv(tolower(comuna), from = 'UTF-8', to = 'ASCII//TRANSLIT')) %>%
select(-comuna),
by = "comuna_match") %>%
#rename(comuna = comuna.x) %>%
select(-c(comuna_match, fecha)) %>%
select(-c(semana_epidemiologica, inicio_semana_epidemiologica, fin_semana_epidemiologica))
glimpse(casen_datos_covid)
return(casen_datos_covid)
})
output$selector_y <- renderText({ input$selector_y })
output$selector_x <- renderText({ input$selector_x })
#actualizar selectores ----
#pone la lista de variables en cada selector
updateSelectizeInput(session,
inputId = "selector_y",
#choices = variables,
choices = variables,
selected = sample(variables, 1)
)
updateSelectizeInput(session,
inputId = "selector_x",
choices = variables,
selected = sample(variables, 1)
)
updateSelectizeInput(session,
inputId = "selector_size",
choices = variables,
selected = sample(variables, 1)
)
#pone las comunas en el selector de comunas
updatePickerInput(session,
inputId = "selector_comunas",
choices = casen_datos %>% select(comuna) %>% distinct() %>% pull() %>% as.character(),
selected = c("La Florida", "Puente Alto", "La Cisterna", "Cerrillos", "Ñuñoa", "Vitacura", "Providencia")
)
#actualiza los selectores de tipo para poner "no aplica" en las variables que no tienen mediana (las de conteo)
observeEvent(input$selector_x, {
if(input$selector_x %in% variables_conteo) {
updateSelectInput(session,
inputId = "tipo_elegido_x",
choices = c("No aplica" = "promedio"),
selected = c("No aplica" = "promedio"))
}
})
observeEvent(input$selector_y, {
if(input$selector_y %in% variables_conteo) {
updateSelectInput(session,
inputId = "tipo_elegido_y",
choices = c("No aplica" = "promedio"),
selected = c("No aplica" = "promedio"))
}
})
observeEvent(input$selector_size, {
if(input$selector_size %in% variables_conteo) {
updateSelectInput(session,
inputId = "tipo_elegido_size",
choices = c("No aplica" = "promedio"),
selected = c("No aplica" = "promedio"))
}
})
#gráfico ----
output$grafico <- renderPlot({
req(casen_datos_covid())
req(input$selector_y)
#variables del gráfico ----
variable_y = input$selector_y #"ytotcorh"
variable_x = input$selector_x #"numper"
variable_col = "comuna"
variable_size = input$selector_size #"s4"
comunas_elegidas <- input$selector_comunas#c("La Florida", "Puente Alto", "Vitacura")
tipo_elegido_x = input$tipo_elegido_x #"promedio"
tipo_elegido_y = input$tipo_elegido_y #"promedio"
tipo_elegido_size = input$tipo_elegido_size #"mediana"
#estética ----
aes_mapping <- aes_string(
x = variable_x,
y = variable_y,
col = variable_col,
size = variable_size
)
#ggplot ----
p <- casen_datos_covid() %>%
#crear columnas de promedio/mediana
tidyr::pivot_wider(names_from = tipo, values_from = 2:25) %>%
#seleccionar variables y tipos elegidos
select(comuna,
paste(variable_x, tipo_elegido_x, sep="_"),
paste(variable_y, tipo_elegido_y, sep="_"),
#all_of(variable_col),
paste(variable_size, tipo_elegido_size, sep="_")) %>%
rename_all(list(~ stringr::str_remove(., "_promedio"))) %>%
rename_all(list(~ stringr::str_remove(., "_mediana"))) %>%
#filtrar comunas
filter(comuna %in% comunas_elegidas) %>%
#graficar
ggplot(mapping = aes_mapping) +
geom_point(col= "white") +
geom_point(alpha=0.7) +
ggrepel::geom_text_repel(aes(label = comuna),
size = 5, point.padding = 1,
min.segment.length = 2,
show.legend = FALSE) +
#escalas
scale_size(range = c(6, 20),
labels = function(x) format(x, big.mark = ".", decimal.mark = ",")) +
scale_y_continuous(labels = function(x) format(x, big.mark = ".", decimal.mark = ",")) +
scale_x_continuous(labels = function(x) format(x, big.mark = ".", decimal.mark = ",")) +
#viridis::scale_color_viridis(discrete = TRUE, option = "magma") +
#fishualize::scale_color_fish(option = "Oncorhynchus_tshawytscha", discrete = TRUE) +
rcartocolor::scale_color_carto_d(type = "qualitative",
#palette = "Sunset"
#palette = "Vivid"
palette = "Pastel"
) +
coord_cartesian(clip = "off") +
#tema
theme_light(base_size = 18) +
theme(legend.position = "right") +
theme(axis.line = element_line(size = 1, color = "gray40", lineend = "round"),
axis.ticks = element_blank(),
panel.grid.major = element_line(size=0.5, color="gray80"),
panel.grid.minor = element_blank(),
panel.border = element_blank(),
axis.text = element_text(color= "gray60", size=13),
legend.text = element_text(color= "gray60", size = 13),
legend.title = element_text(color= "gray60", face = "bold", size = 14),
axis.title = element_text(color= "gray60", face = "bold", size = 14)) +
guides(size = guide_legend(override.aes = list(color = "gray60")),
col = guide_legend(override.aes = list(size = 6))) +
#etiquetas
labs(y = names(variables)[variables == variable_y], #obtener del vector nombrado
x = names(variables)[variables == variable_x],
col = "Comunas",
size = names(variables)[variables == variable_size]
)
return(p)
})
# #tabla ----
#
# output$tabla <- renderFormattable({
# req(input$selector_y)
#
# #variables del gráfico ----
# variable_y = input$selector_y #"ytotcorh"
# variable_x = input$selector_x #"numper"
# variable_col = "comuna"
# variable_size = input$selector_size #"s4"
#
# comunas_elegidas <- input$selector_comunas#c("La Florida", "Puente Alto", "Vitacura")
#
# tipo_elegido_x = input$tipo_elegido_x #"promedio"
# tipo_elegido_y = input$tipo_elegido_y #"promedio"
# tipo_elegido_size = input$tipo_elegido_size #"mediana"
#
#
# t <- casen_datos_covid() %>%
# #crear columnas de promedio/mediana
# tidyr::pivot_wider(names_from = tipo, values_from = 2:25) %>%
# #seleccionar variables y tipos elegidos
# select(comuna,
# paste(variable_x, tipo_elegido_x, sep="_"),
# paste(variable_y, tipo_elegido_y, sep="_"),
# all_of(variable_col),
# paste(variable_size, tipo_elegido_size, sep="_")) %>%
# rename_all(list(~ stringr::str_remove(., "_promedio"))) %>%
# rename_all(list(~ stringr::str_remove(., "_mediana"))) %>%
# formattable()
#
# t
# })
# output$alerta_repetidas <- renderText({
# if(input$selector_x == input$selector_y) {
# alerta <- "Las variables seleccionadas no pueden repetirse"
# } else if (input$selector_x == input$selector_size) {
# alerta <- "Las variables seleccionadas no pueden repetirse"
# } else if (input$selector_y == input$selector_size) {
# alerta <- "Las variables seleccionadas no pueden repetirse"
# } else {
# alerta <- ""
# }
# return(alerta)
# })
}) #fin