umls_reload.sh

source umls/db.config

$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.bsv_drug.*.mysqldump
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.bsv_drug_syn.*.mysqldump
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.bsv_icd.*.mysqldump
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.bsv_icd_neoplasms.*.mysqldump
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.bsv_icd_syn.*.mysqldump
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.bsv_lab.*.mysqldump
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.bsv_lab_common.*.mysqldump
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.bsv_lab_master.*.mysqldump
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.bsv_lab_mimic.*.mysqldump
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.bsv_loinc2hpo.*.mysqldump
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.bsv_loinc2hpo_lab.*.mysqldump
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.bsv_loinc2hpo_pheno.*.mysqldump
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.bsv_master.*.mysqldump
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.bsv_minus.*.mysqldump
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.bsv_morphology.*.mysqldump
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.bsv_problem.*.mysqldump
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.bsv_problem_master.*.mysqldump
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.bsv_problem_syn.*.mysqldump
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.bsv_proc.*.mysqldump          
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.bsv_proc_syn.*.mysqldump      
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.bsv_topography.*.mysqldump    
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.bsv_topography_syn.*.mysqldump
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.bsv_topography_syn_uniq.*.mysqldump
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.DELETEDCUI.*.mysqldump             
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.ICDO_mapping.*.mysqldump           
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.ICDO_morphology.*.mysqldump        
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.ICDO_topography.*.mysqldump        
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.log.*.mysqldump                    
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.loinc2hpo.*.mysqldump              
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MERGEDCUI.*.mysqldump              
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRAUI.*.mysqldump                  
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRCOLS.*.mysqldump                 
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRCONSO.*.mysqldump                
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRCONSO_freq_tty.*.mysqldump       
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRCONSO_hpo.*.mysqldump            
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRCONSO_icd.*.mysqldump            
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRCONSO_loinc.*.mysqldump          
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRCONSO_loinc2hpo.*.mysqldump      
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRCONSO_loinc2hpo_clean.*.mysqldump
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRCONSO_loinc2hpo_lab.*.mysqldump  
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRCONSO_loinc2hpo_lab_syn.*.mysqldump
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRCONSO_loinc2hpo_pheno.*.mysqldump  
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRCONSO_loinc_claim.*.mysqldump      
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRCONSO_loinc_clin.*.mysqldump       
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRCONSO_loinc_clinical.*.mysqldump   
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRCONSO_loinc_lab.*.mysqldump        
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRCONSO_loinc_survey.*.mysqldump     
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRCONSO_long.*.mysqldump             
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRCONSO_minus.*.mysqldump            
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRCONSO_rela.*.mysqldump             
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRCONSO_semtype.*.mysqldump          
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRCONSO_snomed.*.mysqldump           
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRCUI.*.mysqldump                    
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRDEF.*.mysqldump                    
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRDOC.*.mysqldump                    
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRFILES.*.mysqldump                  
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRHIER.*.mysqldump                   
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRMAP.*.mysqldump                    
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRRANK.*.mysqldump                   
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRREL.*.mysqldump                    
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRREL_concentration.*.mysqldump      
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRREL_freq_rela.*.mysqldump          
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRREL_loinc.*.mysqldump              
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRREL_rela.*.mysqldump               
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRREL_rela_rank.*.mysqldump          
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRSAB.*.mysqldump                    
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRSAT.*.mysqldump                    
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRSAT_ICDO.*.mysqldump               
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRSAT_loinc.*.mysqldump              
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRSAT_loinc_common.*.mysqldump       
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRSAT_loinc_comp.*.mysqldump         
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRSAT_loinc_freq.*.mysqldump         
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRSAT_loinc_lab.*.mysqldump          
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRSAT_loinc_panel.*.mysqldump        
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRSAT_loinc_units.*.mysqldump        
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRSAT_morphology.*.mysqldump         
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRSAT_rxnorm.*.mysqldump             
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRSAT_topography.*.mysqldump         
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRSMAP.*.mysqldump                   
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRSTY.*.mysqldump                    
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRSTY_copy.*.mysqldump               
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRSTY_freq.*.mysqldump               
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRXNS_ENG.*.mysqldump                
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRXNW_ENG.*.mysqldump                
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.MRXW_ENG.*.mysqldump                 
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.pref_drug.*.mysqldump                
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.pref_problem.*.mysqldump             
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.pref_problem_freq.*.mysqldump        
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.README.*.mysqldump                   
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.save_ccs_diag_icd9.*.mysqldump       
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.save_DX.*.mysqldump                  
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.save_DX_concept.*.mysqldump          
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.save_hier_lab.*.mysqldump            
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.save_hier_lab_uniq.*.mysqldump       
$mysql_dataset < umls/mysqldump/umls.save_lab_code.*.mysqldumpa