camp2023-57017-deu-Wie_synthetisiert_man_DNA_opus.srt

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 [Musik]

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00:00:30,000 --> 00:00:36,000
 Dann zum Talk. Wie synthetisiert man DNA von XRO?

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00:00:36,000 --> 00:00:39,000
 DNA ist wichtig, aber wie stellt man sie eigentlich hier?

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00:00:39,000 --> 00:00:42,000
 Vor allem, wenn man keine Körperzelle ist oder irgendeine Zelle.

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00:00:42,000 --> 00:00:47,000
 Das Verfahren heißt Phosphoramiditsynthese.

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00:00:47,000 --> 00:00:51,000
 Und wenn ihr genauso viel Ahnung habt, was das sein könnte oder wissen wollt, was es eigentlich ist,

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00:00:51,000 --> 00:00:54,000
 dann wird er es euch jetzt vorstellen. Viel Spaß beim Talk.

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00:00:54,000 --> 00:01:02,000
 Ja, hi, grüß euch. Ich bin der XRO.

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00:01:02,000 --> 00:01:09,000
 Und bin in meiner Profisleinlaufbahn ein bisschen mit DNA-Synthese berühren gekommen

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00:01:09,000 --> 00:01:14,000
 und haben gedacht, na gut, erzählen wir mal aus Informatikersicht, wie das passiert.

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00:01:14,000 --> 00:01:23,000
 Und für alle, die jetzt keine Chemiegeek sind, sondern wie ich da neu eingestiegen bin irgendwann vor ein paar Jahren.

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00:01:23,000 --> 00:01:29,000
 Okay, zu mir. Ich habe normales Informatik, Elektronik, Wissenschaft.

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00:01:29,000 --> 00:01:36,000
 Ich sehe gerne Leute, habe ein bisschen Startup-XP, leider oder hoffentlich, je nachdem, wie man es sieht.

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00:01:36,000 --> 00:01:40,000
 Und baue DNA-Synthesizer und Automatisierung.

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00:01:40,000 --> 00:01:44,000
 Sonst bastelt gerne Zeugs, wie da am Camp.

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00:01:44,000 --> 00:01:48,000
 Und ihr könnt mich für Fragen anrufen unter 2XRO.

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00:01:48,000 --> 00:01:53,000
 Oder sonst findet ihr mich da hinten bei der Reall-ROM-Ville.

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00:01:53,000 --> 00:01:58,000
 Wir haben einen Hacker-Space in Graz und der hat auch einen Biohacker-Space dazu.

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00:01:58,000 --> 00:02:03,000
 Das war so 2013 die erste Berührung, wo ich da in die Richtung,

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00:02:03,000 --> 00:02:08,000
 also eigentlich haben wir den gegründet, weil ich da mit in Berührung kommen wollte, aber genau.

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00:02:08,000 --> 00:02:14,000
 Da gibt es auch ein schönes offenes Labor, da kann man Dinge machen und sich ein bisschen mit der Materie beschäftigen.

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00:02:14,000 --> 00:02:19,000
 Und ja, genau. Warnung, wie gesagt, ich bin kein Molekularbiologe.

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00:02:19,000 --> 00:02:22,000
 Ich hoffe, ich kann eure Fragen beantworten nachher.

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00:02:22,000 --> 00:02:27,000
 Aber ich habe das auch gelernt. Vielleicht ist es dann gut, anderen Leuten beizubringen.

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00:02:27,000 --> 00:02:30,000
 So, DNA-Synthese.

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00:02:30,000 --> 00:02:36,000
 Prinzipiell, was heißt das? Das heißt, wir haben eine Textsequenz, G, A, T, irgendwas,

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00:02:36,000 --> 00:02:43,000
 aus vier oder mehr Buchstaben, weil man könnte ja auch synthetische DNA haben, das gibt es.

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00:02:43,000 --> 00:02:56,000
 Und wollen diese Textdatei, diese Information in ein echtes physikalisches Modul in Realität bringen, also quasi drucken.

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00:02:56,000 --> 00:03:03,000
 Warum, was braucht man dafür? Das kann man verwenden für Diagnostik, therapeutische Methoden

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00:03:03,000 --> 00:03:08,000
 und wie wir jetzt nach den letzten zwei Jahren alle wissen, auch für Impfungen.

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00:03:08,000 --> 00:03:15,000
 Die klassische Messenger mRNA und eigentlich ist es sogar so, dass ich glaube, 50 Prozent aller Medikamente derzeit

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00:03:15,000 --> 00:03:21,000
 mit Molekularbiologischen Methoden hergestellt werden und Tendenz stark steigend.

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00:03:21,000 --> 00:03:28,000
 Funktioniert zum Beispiel so, ich habe eine Zelle und ich programmiere einfach um, was diese Zelle tut

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00:03:28,000 --> 00:03:34,000
 und bringe sie dazu, einen Wirkstoff herzustellen, der dann halt medizinische Anwendungen hat.

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00:03:34,000 --> 00:03:41,000
 Oder wie ich kenne auch Leute, die haben sich überlegt, okay, wir wollen Wolle ersetzen durch einen String,

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00:03:41,000 --> 00:03:49,000
 Keffler-ähnige Eigenschaften, so Heckfisch-Strings oder Spinnenseide und programmieren Zellen um, um das herzustellen

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00:03:49,000 --> 00:03:55,000
 und dann müssen sie das nur mehr rausfiltern. Das rausfiltern stellt sich raus, ist dann das Schwierige.

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00:03:55,000 --> 00:04:03,000
 Genau, so aber wie synthetisiert man DNA? Tatsächlich gibt es abhängig von der Länge unterschiedliche Methoden.

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00:04:03,000 --> 00:04:10,000
 Wir fokussieren uns jetzt mal hauptsächlich auf die Oligonuklidizynthese, so bis zu 200 Basen.

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00:04:10,000 --> 00:04:20,000
 Also das ist das ziemlich obere Maximum. Üblich ist so 100 bis 50 oder so für diese vier kurzen Basensequenzen

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00:04:20,000 --> 00:04:27,000
 genannt Oligonuklide, weil Oligo wenig und da geht es um chemische Synthese.

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00:04:27,000 --> 00:04:34,000
 Das heißt, ich mische der Reihe nach Chemikalien, die ich mir irgendwo herbesorge in der richtigen Reihenfolge,

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00:04:34,000 --> 00:04:40,000
 in der richtigen Menge und dann bildet sich ein Molekül, also am Strangsynthesieren.

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00:04:40,000 --> 00:04:46,000
 Es gibt auch noch andere Methoden, wie die enzymatische Synthese, das ist jetzt voll der Hype und das kommt immer wieder

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00:04:46,000 --> 00:04:52,000
 und crasht auch wieder ein bisschen, weil es dann doch immer noch nicht so gut funktioniert, wie Leute das ganz gern hätten.

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00:04:52,000 --> 00:04:59,000
 Oder so viel besser, muss man fast sagen. Aber ja, das ist die andere Methode natürlich, die theoretisch coolere Methode.

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00:04:59,000 --> 00:05:06,000
 Ich bringe Enzyme dazu, meine DNA aufzubauen, genauso wie es im Körper funktioniert.

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00:05:06,000 --> 00:05:13,000
 Man ist noch dabei, das zu optimieren, das Stand der Dinge ist die chemische Synthese.

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00:05:13,000 --> 00:05:23,000
 Und natürlich für lange Sequenzen geht es vereinfacht gesagt daran, dass ich dann die kurzen Sequenzen irgendwie zusammenstoppele.

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00:05:23,000 --> 00:05:28,000
 Zu den kurzen, zu den Oligos, wie man es so schön im Umgangssprache nennt.

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00:05:28,000 --> 00:05:38,000
 Wo kommt das über her? Wie gesagt, Oligo ist wenig und Nukleodid, es halten Nukleosid plus Phosphor. Ja, genau.

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00:05:38,000 --> 00:05:46,000
 Aber was macht man mit diesen kurzen Stücken? Tut man die einfach nur nehmen, um dann die großen Langen daraus zu machen,

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00:05:46,000 --> 00:05:52,000
 wie man die DNA an der Zelle hat? Oder tun die auch selber was? Ja, die haben selber auch eine Funktion.

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00:05:52,000 --> 00:06:00,000
 Und zwar reicht es schon, wenn ich so ein 50 bis 100 Basenstück nehme, damit kann ich auch schon ganz viel tun, und zwar Enzyme steuern.

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 Also nur weil ihr euch fragt, warum tut man das überhaupt, warum synthetisiert man DNA, warum überhaupt der Vortrag?

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00:06:06,000 --> 00:06:13,000
 Also es gibt ganz viele Methoden, vielleicht hat schon mal jemand gehört von CRISPR-Cas9, ganz sicher habt ihr schon gehört von PCA-Methode,

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00:06:13,000 --> 00:06:20,000
 weil ich würde mal sagen, 100% haben wir mal einen PCA-Test gemacht in den letzten zwei Jahren.

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00:06:20,000 --> 00:06:28,000
 Da geht es im Prinzip darum, dass ich schaue, ob ein DNA-Stück matcht auf die Probe, dass ich reindufe.

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00:06:28,000 --> 00:06:34,000
 Also die Probe ist mein Speichel natürlich, und ich will schauen, welche DNA in dieser Probe drin ist.

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00:06:34,000 --> 00:06:40,000
 Da wird alles Mögliche drin sein, von allem, was ich gerade gegessen habe, plus meine DNA, plus irgendwelche Viren.

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00:06:40,000 --> 00:06:51,000
 Und jetzt kann ich halt schauen, ich synthetisier ein kurzes Stück, und dann schaue ich, matcht das zu irgendetwas, was in meiner Probe drin ist.

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00:06:51,000 --> 00:06:56,000
 Das macht eben diese PCA-Methode, und das, was ich matche, ist das, was ich drucke quasi.

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00:06:56,000 --> 00:07:06,000
 Das heißt, ich könnte jetzt auf Covid testen, ich könnte auf Pferdefleisch versus kühner Fleisch testen, was ich halt machen will.

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00:07:06,000 --> 00:07:10,000
 Ich muss es nur drucken, in die Pierzemische reintun und testen.

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00:07:10,000 --> 00:07:22,000
 Tatsächlich ist es ein bisschen modifizierter, den A, weil die hat dann auch leuchtende Moleküle drauf, damit ich dann auch optisch messen kann, aber das ist es im Prinzip.

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00:07:22,000 --> 00:07:28,000
 Und woher bekomme ich diese Oligos? Mehr oder weniger, sage ich jetzt mal, drei Methoden.

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00:07:28,000 --> 00:07:36,000
 Entweder ich mache es so, wie in den 80er Jahren, als die Methode erfunden wurde, ich pippetiere es selbst im Labor.

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00:07:36,000 --> 00:07:39,000
 Das kann quasi jeder machen, es dauert halt nur.

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00:07:39,000 --> 00:07:50,000
 Das komplett Opposite davon ist, ich order es im Internet, gebe meine Sequenz ein, und dann warte ich halt ein paar Tage oder Wochen, bis das Ding irgendwann bei mir ankommt.

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00:07:50,000 --> 00:08:00,000
 Oder ich habe einen Oligosynthesizer im Labor, tippe einfach die Sequenz ein, drücke auf Print und dann ein paar Stunden später arbeite ich weiter.

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00:08:00,000 --> 00:08:05,000
 Aber wie funktioniert der? Das wäre zum Beispiel so ein Beispiel Oligosynthesizer.

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00:08:05,000 --> 00:08:10,000
 Das eine Ding, das haben wir mal zum Spaß vor vielen, vielen Jahren selbst gebaut im Labor.

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00:08:10,000 --> 00:08:19,000
 Das ist quasi so ein fertiges Produkt, das so streamlined gut funktioniert, dem man eine Sequenz gibt, eindrückt, Print drückt und wie arbeiten die?

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00:08:19,000 --> 00:08:21,000
 Darum geht es jetzt im Prinzip.

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00:08:21,000 --> 00:08:26,000
 Und ich würde sagen, am besten schauen wir uns ein Beispiel an.

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00:08:26,000 --> 00:08:30,000
 Was synthetisieren wir? Natürlich Gatagra, eh klar.

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00:08:30,000 --> 00:08:36,000
 Wie synthetisieren wir? Ja, okay, keine Doppelhelix.

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00:08:36,000 --> 00:08:43,000
 Wir machen Single Molekülstrand, wir machen ein langes Molekül, wo wir Molekül an Molekül an Molekül der Reihe nach anhängen.

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00:08:43,000 --> 00:08:54,000
 Wenn ich dann eine Doppelhelix daraus machen will, fahre ich zum Beispiel PCA und mache da nochmal die Methode drüber, die mir das invers verdoppelt.

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00:08:54,000 --> 00:09:02,000
 Also dann wird es natürlich noch stabiler, aber für die meisten Methoden reicht die, oder will ich sogar die nicht stabile Version haben.

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00:09:02,000 --> 00:09:05,000
 Ja, ich habe natürlich die vier Bausteine.

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00:09:05,000 --> 00:09:13,000
 Gurnin, Cytisin, Adenin, Thymin, das sind die klassischen in der Natur vorkommenden vier Basen.

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00:09:13,000 --> 00:09:21,000
 Und was ich jetzt quasi einkaufe, sind die Phosphoarmedite, die vier Phosphoarmedite, die diesen vier Basen entsprechen.

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00:09:21,000 --> 00:09:26,000
 Das ist quasi mein Baukasten. Aus der Chemie baue ich das dann zusammen.

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00:09:26,000 --> 00:09:34,000
 Wie schaut so ein Phosphoarmedit aus? Ich stresse euch nicht zu viel damit, aber man hat halt eine Schutzgruppe,

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00:09:34,000 --> 00:09:44,000
 da ist das TMT drauf, man hat die Phase, die ich anhängen will der Reihe nach und dann habe ich so einen Stützzucker.

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00:09:44,000 --> 00:09:48,000
 Und irgendwie muss das Ding ja am Platz bleiben.

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00:09:48,000 --> 00:09:56,000
 Das heißt, im Prinzip spüle ich Flüssigkeiten, Chemikalien der Reihe nach hintereinander und dann würde ich ja eigentlich auch alles wegspülen.

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00:09:56,000 --> 00:10:01,000
 Wie bleibt die DNA am Platz? Meistens habe ich sie in so einem CPG-Linkenmuster.

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00:10:01,150 --> 00:10:07,150
 also ein CPG ist halt so ein Salt Support, Controlled Poreglass, das ist genauso groß,

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00:10:07,150 --> 00:10:12,150
 dass ich drinnen ein großes Molekül synthetisieren kann, das bleibt dann drin, das kann auch nicht raus.

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00:10:12,150 --> 00:10:19,150
 An dieses Molekül hänge ich ein anderes Molekül an, so einen langen Spacer, und an dem starte ich meine Synthese.

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00:10:19,150 --> 00:10:26,150
 Und weil ich das Glaskühlchen quasi wirklich festhalte, kann das nicht weg, an dem kann ich Chemikalien vorbeispülen

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00:10:26,150 --> 00:10:31,150
 oder das drin reagieren lassen, und am Schluss kann ich das rausnehmen auf irgendeine Art und Weise.

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00:10:31,150 --> 00:10:35,150
 Also es gibt auch ferromagnetische Kügelchen, Glaskübelchen, ich kann das rausschieben,

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00:10:35,150 --> 00:10:39,150
 ich kann es aufreinigen und dann ausspülen, ich kann es abtrennen.

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00:10:39,150 --> 00:10:45,150
 Ja, wie funktioniert das? Wie gesagt, wir haben unsere Schutzgruppe, wir haben unser Base, unsere Linke,

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00:10:45,150 --> 00:10:52,150
 wir haben die Base, und im Gegensatz zur Natur arbeiten wir von hinten, von 3 Strich auf 5 Strich.

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00:10:52,150 --> 00:10:57,150
 Nur falls es jemand vermiert die Natur, geht 5 nach 3. Und das ist der Kreislauf.

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00:10:57,150 --> 00:11:03,150
 Darum geht es eigentlich, das wollte ich euch zeigen. Ich mache der Reihe nach diese Dinge,

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00:11:03,150 --> 00:11:07,150
 ich tue diese Art von Chemikalien der Reihe nach über dieses Control Poor Glass,

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00:11:07,150 --> 00:11:13,150
 über den Solid Support drüberspülen und baue damit der Reihe nach das lange Molekül auf.

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00:11:13,150 --> 00:11:19,150
 Das Nummer 1, ich habe die Detrivelierung, das heißt von dieser Schutzgruppe, die nehme ich runter,

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00:11:19,150 --> 00:11:24,150
 dann habe ich das Molekül frei, dann kann ich was nächstes anhängen, dann kommt die Kopplung,

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00:11:24,150 --> 00:11:29,150
 dann kommt ein bisschen Stabilisierung, in dem Fall nehmen wir dafür Sauerstoff, Oxidier,

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00:11:29,150 --> 00:11:33,150
 und dann machen wir sogenannte Capping. Und was ist das? Erzähle ich auch alles.

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00:11:33,150 --> 00:11:39,150
 Und am Schluss Cleaving, ich spalte das von diesem Solid Support runter, damit ich das in freier,

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00:11:39,150 --> 00:11:46,150
 frei verfügbar habe, das Molekül in meiner Lösung. Und das kann ich dann zum Beispiel in eine PCA-Maschine tun.

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00:11:46,150 --> 00:11:53,150
 So, Beispiel. Hier habe ich das so aufgebaut, wir fangen an mit Coupling, das L steht für Linker,

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00:11:53,150 --> 00:12:00,150
 G steht für die erste Base und am Schluss von dem String ist dann DMT, meine Schutzgruppe.

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00:12:00,150 --> 00:12:07,150
 Das heißt ich mache einmal ein Coupling, ich starte mit Linker, tue ein G dran, das mit dem DMT gleich kommt,

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00:12:07,150 --> 00:12:13,150
 und dann tue ich irgendwann das DMT runter, dann hänge ich ein A dran, das wieder mit seinem DMT kommt,

113
00:12:13,150 --> 00:12:19,150
 dann nehme ich ein T und tue das mit seinem DMT dran und fertig. Und so wird eine Reihe nach der String aufgebaut,

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00:12:19,150 --> 00:12:23,150
 bis ich bei meinem Ziel Gatagar bin. Und am Schluss mache ich eben das Cleaving,

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00:12:23,150 --> 00:12:29,150
 tue ich das DMT und die Schutzgruppen weg und dann ist das Gatagar schwind halt frei rum

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00:12:29,150 --> 00:12:34,150
 und kann ich es irgendwo in meiner Lösung verwenden. Und ja, das DMT unten hinten, ja warum?

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00:12:34,150 --> 00:12:41,150
 Warum detritüliere ich eigentlich? Also der erste Schritt. Ja, wenn ich das nicht machen würde,

118
00:12:41,150 --> 00:12:47,150
 wenn die Basen nicht mit einer so Schutzgruppe schon fix fertig dran kommen würden und ich habe so ein Gat

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00:12:47,150 --> 00:12:54,150
 und ich spüle ein T und das ist ja probabilistische Reaktion, da spüle ich ja ganz ganz ganz viele T's drüber,

120
00:12:54,150 --> 00:12:57,150
 dann würde ich ja, oder A's, dann würde ich sie alle auf einmal anhängen.

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00:12:57,150 --> 00:13:05,150
 Deswegen habe ich eben diese Phosphor-Medite, die alle mit der Schutzgruppe kommen, das heißt hinter ein T plus DMT,

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00:13:05,150 --> 00:13:12,150
 da kann sie nicht noch ein T anhängen, bevor ich das DMT wegnehme, weil sonst wird das eben so ausschauen.

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00:13:12,150 --> 00:13:21,150
 So, und warum Capping? Reden wir kurz über Coupling Efficiency, wie gesagt, probabilistisches Verfahren.

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00:13:21,150 --> 00:13:27,150
 Ich hoffe, dass es funktioniert. Es gibt eine gewisse Wahrscheinlichkeit, dass die chemischen Reaktionen funktionieren.

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00:13:27,150 --> 00:13:36,150
 Die liegt normalerweise eh ganz gut, so bis 0,99 bis 100%, aber ich mache das ja oft und wie wir es wissen,

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00:13:36,150 --> 00:13:44,150
 Fehlerverpflanzung, mit jedem Mal multipliziere ich meine Fehlerwahrscheinlichkeit und nach 100, 200 Basen

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00:13:44,150 --> 00:13:51,150
 bin ich dann so unter 50%, dass ich wirklich das habe, was ich haben will und ganz viele Fehler schwimmen dann nebenbei herum.

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00:13:51,150 --> 00:13:56,150
 Die müsste ich entweder aufreinigen, irgendwo wegspülen oder sonst was.

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00:13:56,150 --> 00:14:03,150
 Weil die reagieren dann ja auch in der Methode und tun dann vielleicht etwas anderes, was sie machen, machen sie einen Fehlersignal.

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00:14:03,150 --> 00:14:10,150
 Daher Capping. Capping passiert so, dass wenn ich dann meine erste Base angehängt habe,

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00:14:10,150 --> 00:14:21,150
 dann hänge ich noch einmal bei allem, was nicht reagiert hat, sprich wo dann nicht hinten ein DMT draufhängt,

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00:14:21,150 --> 00:14:26,150
 weil das DMT kommt ja von dem Phosphormedit, das ich anhänge, dafür habe ich es ja gekauft.

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00:14:26,150 --> 00:14:37,150
 Und dann cappe ich einfach alles weg, wo das neue DMT nicht hinten anhängt und damit kann ich das nachher wegfiltern.

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00:14:37,150 --> 00:14:42,150
 Das heißt ich verhindere weitere Reaktionen von allem, was nicht fertig sanitisiert hat.

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00:14:42,150 --> 00:14:53,150
 Genau, wenn ich das nicht hätte, dann würde einfach zum Beispiel ein Fehler passieren können im Strang F,

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00:14:53,150 --> 00:15:01,150
 also dass es da so wie es gehen soll, GAT, GATT, GATAC, aber da würde halt ein T fehlen,

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00:15:01,150 --> 00:15:05,150
 aber wir würden das ACA ganz normal weiter dranbauen. Das wollen wir eben nicht,

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00:15:05,150 --> 00:15:13,150
 weil dann am Schluss hätten wir neben unserem Ziel Länge 20 auch noch ganz viele mit 19 und mit 18

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00:15:13,150 --> 00:15:17,150
 und wenn das dann alles dieselbe Masse hat, wird es umso schwieriger wegzufiltern.

140
00:15:17,150 --> 00:15:22,150
 Daher wollen wir, dass die fehlerhaften Stränge möglichst kurz bleiben.

141
00:15:22,150 --> 00:15:29,150
 Deswegen Capping. Überall dort, wo das DMT es nicht drauf geschafft hat, das Table DMT,

142
00:15:29,150 --> 00:15:33,150
 kommt dann ein Cap hinten dran und während der andere String weiter wächst,

143
00:15:33,150 --> 00:15:37,150
 bleibt das kurz und lässt sich nachher leichter wegfiltern.

144
00:15:37,150 --> 00:15:42,150
 So, genau, maximal Länge, ich habe es vorhin schon erwähnt, die coupling-efficient ist schuld.

145
00:15:42,150 --> 00:15:51,150
 Ich kann mit dieser Methode nicht beliebig lange synthesisieren, ohne dass die Menge des erfolgreichen Produktes

146
00:15:51,150 --> 00:15:53,150
 verschwindend klein wird.

147
00:15:53,150 --> 00:16:02,150
 Genau, und wie weiß ich dann am Schluss, ob das, was ich synthesisiert habe, überhaupt funktioniert hat?

148
00:16:02,150 --> 00:16:09,150
 Ja, tatsächlich bei so kurzen Methoden funktionieren die klassischen Sequenzierungsmethoden sehr schwer,

149
00:16:09,150 --> 00:16:17,150
 deswegen gehe ich auf die Masse des Moleküls oft und mache halt Nassenspektrokopie und HPLC

150
00:16:17,150 --> 00:16:22,150
 und dann versuche ich halt wegzufiltern, was nicht funktioniert hat.

151
00:16:22,150 --> 00:16:29,150
 Genau, was wir auch zum Beispiel gemacht haben, man kann zum Beispiel online Prozesskontrolle machen,

152
00:16:29,150 --> 00:16:35,150
 das Trithyl, das ich wegspüle, hat eine Farbe und ich kann zum Beispiel anhand dessen,

153
00:16:35,150 --> 00:16:41,150
 wie viel von dem weggespült hat, sagen, wie gut die Reaktion funktioniert hat.

154
00:16:41,150 --> 00:16:50,150
 Ja, genau, und dann habe ich einen fertigen Single-DNA-Strang und den kann ich dann eben verwenden,

155
00:16:50,150 --> 00:16:55,150
 um längere DNA-Stränge zu bauen oder eben direkt in irgendwelche Methoden verwenden, um Dinge zu machen.

156
00:16:55,150 --> 00:17:03,150
 Zum Beispiel Analyse, BCA, so Realtime QPCA ist das, was ich mit dem leuchtenden Molekül vorher erwähnt habe,

157
00:17:03,150 --> 00:17:10,150
 da tue ich auf meinen Linker oder hinten dran dann nochmal eine Sonde oder so,

158
00:17:10,150 --> 00:17:14,150
 die mir dann im UV-Licht zum Beispiel zeigt, wie viel dann reagiert hat.

159
00:17:14,150 --> 00:17:20,150
 Oder ich editiere tatsächlich Gene, ich nehme zum Beispiel die CRISPR-Cas9-Methode

160
00:17:20,150 --> 00:17:27,150
 und sage mit Primers schneide von hier bis hier irgendwas aus der DNA raus oder tue dann was wieder rein.

161
00:17:27,150 --> 00:17:41,150
 Oder in der Therapie für genetisch bedingte Krankheiten oder auch, wenn ich irgendein Gene-Silencing in Viren oder Zellen machen will

162
00:17:41,150 --> 00:17:47,150
 oder Bakterien, die mich angreifen, aber hauptsächlich geht es darum in Patienten, wenn die irgendeine Mutation haben,

163
00:17:47,150 --> 00:17:55,150
 dann kann ich regelmäßig so siRNA verabreichen, die dann gewisse Gene-Mechanismen ausschalten.

164
00:17:55,150 --> 00:17:59,150
 Kann ich auch mit diesen kurzen Stücken machen.

165
00:17:59,150 --> 00:18:03,150
 Ja, das ist im Prinzip die kurze DNA-Synthese.

166
00:18:03,150 --> 00:18:07,150
 Weil jemand vielleicht fragt, ok, was ist mit langen Stücken?

167
00:18:07,150 --> 00:18:13,150
 Nur ganz kurzer Ausblick, wie gesagt, ich kann die kurzen Stücke nehmen,

168
00:18:13,150 --> 00:18:22,150
 kann dann zum Beispiel sowas wie Gibson Assembly machen, das heißt ich synthetisee so, dass ich immer überlappende Stücke habe

169
00:18:22,150 --> 00:18:27,150
 und dann mit einem bestimmten Unzym verkopple ich die zu langen Stücken.

170
00:18:27,150 --> 00:18:33,150
 Oder es gibt auch die Methode, dass ich ganz kurze Oligonautik-Lieder mit so drei Basen nehme

171
00:18:33,150 --> 00:18:45,150
 und durch eine Computerinformatikoptimierung mir die beste Kombination näher, wie ich am schnellsten das zusammenhängen kann,

172
00:18:45,150 --> 00:18:48,150
 aneinanderhängen kann und daraus lange Sequenzen machen kann.

173
00:18:48,150 --> 00:18:58,150
 Oder ich mache so ein Massive Parallel Chip-Ding, wo ich bei 1024 kleinen Cavities auf einem kleinen mikrophilischen Chip

174
00:18:58,150 --> 00:19:05,150
 parallel synthetisiere, indem ich halt jedes von diesen Kammern, wo parallel diese Phosphor-Methy-Synthese passiert,

175
00:19:05,150 --> 00:19:11,150
 ein ausschalte, ob sie an dem aktuellen Drüberspülen von Chemikalien teilhaben soll oder nicht.

176
00:19:11,150 --> 00:19:23,150
 Und dann habe ich so 1024 kurze Sequenzen nebeneinander und dann lasse ich die auf einmal frei und verbinde sie zum Beispiel mit Gibson Assembly.

177
00:19:23,150 --> 00:19:28,150
 Das war's. 0 Minuten. Vielen Dank fürs Zuhören.

178
00:19:28,150 --> 00:19:40,150
 Vielen Dank für den Talk. War sehr informativ. Wir haben leider keine Zeit für Fragen, aber ich vermute, du bist eh im Village hier nebenan,

179
00:19:40,150 --> 00:19:45,150
 einfach zu finden gleich. Also wenn jemand sich noch unterhalten will oder Fragen hat, er steht zur Verfügung.

180
00:19:45,150 --> 00:19:52,150
 Ja, entweder beim Dom da hinten, beim Meterlab oder beim Realraum. Und da bin ich auch noch ein bisschen.

181
00:19:52,150 --> 00:19:57,150
 Hervorragend. Dann will ich noch einmal, ja genau, sind wir am Ende. Ich mache die Absagen quasi.

182
00:19:57,150 --> 00:20:02,150
 [Musik]