IC_CaPKA_I1PP1_6.5u.xml

<InitialConditions>

  <ConcentrationSet region="dend">
    <!-- calcium interacting proteins -->
        <NanoMolarity specieID="Ca"           value="60"/>
	<!-- total calbindin = 160 uM -->
        <NanoMolarity specieID="Calbin"       value="159980"/>
        <NanoMolarity specieID="CalbinC"      value="20"/>

	<!-- total calmodulin = 9000 nM (divide AC bound by 3.25)-->
      	<NanoMolarity specieID="Cam"          value="3590"/>
      	<NanoMolarity specieID="CamCa2C"      value="126"/>
      	<NanoMolarity specieID="CamCa2N"      value="20"/>
      	<NanoMolarity specieID="CamCa4"       value="0"/>
	
<!-- total PP2B = 5000 nM-->
        <NanoMolarity specieID="PP2B"                 value="96" />
        <NanoMolarity specieID="PP2BCam"              value="3482" />
        <NanoMolarity specieID="PP2BCamCa2C"          value="1231" />
        <NanoMolarity specieID="PP2BCamCa2N"          value="181" />
        <NanoMolarity specieID="PP2BCamCa4"           value="10" />

    <NanoMolarity specieID="L"            value="2.0"/>
    <NanoMolarity specieID="ATP"          value="1998000.0"/>
    <NanoMolarity specieID="cAMP"         value="130.0"/>
    <NanoMolarity specieID="AMP"          value="0.0"/>
    <NanoMolarity specieID="Epac1cAMP"    value="35.0"/>
    <NanoMolarity specieID="Epac1"        value="1965.0"/>
    <!--1100 PDE4 in both size morphologies -->
    <NanoMolarity specieID="PDE4"         value="1052.0"/>
    <NanoMolarity specieID="pPDE4"        value="15.0"/>
    <NanoMolarity specieID="PKAcPDE4"     value="0.0"/>
    <NanoMolarity specieID="PDE4cAMP"     value="33.0"/>
    <NanoMolarity specieID="pPDE4cAMP"    value="0.0"/>
    
    <NanoMolarity specieID="PKAc" value="0.0"/>
    <NanoMolarity specieID="X" value="1992.0"/>
    <NanoMolarity specieID="pX" value="8.0"/>
<!-- total I1 = 1500, total PP1= 1500 -->
    <NanoMolarity specieID="I1" value="785.0"/>
    <NanoMolarity specieID="I1PKAc" value="0.0"/>
    <NanoMolarity specieID="Ip35" value="7.0"/>
    <NanoMolarity specieID="Ip35PP1" value="708.0"/>
    <NanoMolarity specieID="Ip35PP1PP2BCaMCa4" value="0.0"/>
    <NanoMolarity specieID="PP1" value="792.0"/>
  </ConcentrationSet>
  
  <SurfaceDensitySet region="dend">
    <!--Gtot=3600, Gs2476,Gbg528; Rtot=600-->
    <PicoSD specieID="R"      value="4.0"/>
    <PicoSD specieID="LR"     value="0.0"/>
    <PicoSD specieID="Gs"     value="2934.0"/>
    <PicoSD specieID="GsR"    value="595.0"/>
    <PicoSD specieID="LRGs"   value="1.0"/>
    <PicoSD specieID="pLRGs"  value="0.0"/>
    <PicoSD specieID="GasGTP" value="4.0"/>
    <PicoSD specieID="GasGDP" value="0.0"/>
    <PicoSD specieID="Gbg"    value="70.0"/>

    <PicoSD specieID="PKA"      value="919.0"/>
    <PicoSD specieID="PKAr"     value="0.0"/>
    <PicoSD specieID="PKAcAMP2" value="870.0"/>
    <PicoSD specieID="PKAcAMP4" value="211.0"/>
    <!--7200 AC in large dend, 6294,400,28,0.452,24; 360 AC5 260,10,90 -->
    <PicoSD specieID="AC1"               value="6680.0"/>
    <PicoSD specieID="AC1GasGTP"         value="40.0"/>
    <PicoSD specieID="AC1CamCa4"         value="28.0"/>
    <PicoSD specieID="AC1GasCamCa4"      value="0.0"/>
    <PicoSD specieID="AC1CamCa4ATP"      value="452.0"/>
    <PicoSD specieID="AC1GasCamCa4ATP"   value="0.0"/>
    <PicoSD specieID="AC5"               value="334" />
    <PicoSD specieID="AC5Gas"            value="4" />
    <PicoSD specieID="AC5GasATP"         value="22" />

</SurfaceDensitySet>
</InitialConditions>