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<title>Importation de données dans RStudio</title>
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pre.numberSource code > span
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div.sourceCode
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pre > code.sourceCode > span > a:first-child::before { text-decoration: underline; }
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code span.an { color: #8f5902; font-weight: bold; font-style: italic; } /* Annotation */
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code span.bn { color: #0000cf; } /* BaseN */
code span.cf { color: #204a87; font-weight: bold; } /* ControlFlow */
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code span.er { color: #a40000; font-weight: bold; } /* Error */
code span.ex { } /* Extension */
code span.fl { color: #0000cf; } /* Float */
code span.fu { color: #204a87; font-weight: bold; } /* Function */
code span.im { } /* Import */
code span.in { color: #8f5902; font-weight: bold; font-style: italic; } /* Information */
code span.kw { color: #204a87; font-weight: bold; } /* Keyword */
code span.op { color: #ce5c00; font-weight: bold; } /* Operator */
code span.ot { color: #8f5902; } /* Other */
code span.pp { color: #8f5902; font-style: italic; } /* Preprocessor */
code span.sc { color: #ce5c00; font-weight: bold; } /* SpecialChar */
code span.ss { color: #4e9a06; } /* SpecialString */
code span.st { color: #4e9a06; } /* String */
code span.va { color: #000000; } /* Variable */
code span.vs { color: #4e9a06; } /* VerbatimString */
code span.wa { color: #8f5902; font-weight: bold; font-style: italic; } /* Warning */
</style>
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// apply pandoc div.sourceCode style to pre.sourceCode instead
(function() {
var sheets = document.styleSheets;
for (var i = 0; i < sheets.length; i++) {
if (sheets[i].ownerNode.dataset["origin"] !== "pandoc") continue;
try { var rules = sheets[i].cssRules; } catch (e) { continue; }
var j = 0;
while (j < rules.length) {
var rule = rules[j];
// check if there is a div.sourceCode rule
if (rule.type !== rule.STYLE_RULE || rule.selectorText !== "div.sourceCode") {
j++;
continue;
}
var style = rule.style.cssText;
// check if color or background-color is set
if (rule.style.color === '' && rule.style.backgroundColor === '') {
j++;
continue;
}
// replace div.sourceCode by a pre.sourceCode rule
sheets[i].deleteRule(j);
sheets[i].insertRule('pre.sourceCode{' + style + '}', j);
}
}
})();
</script>
<link rel="stylesheet" href="style.css" type="text/css" />
<style type = "text/css">
.main-container {
max-width: 940px;
margin-left: auto;
margin-right: auto;
}
img {
max-width:100%;
}
.tabbed-pane {
padding-top: 12px;
}
.html-widget {
margin-bottom: 20px;
}
button.code-folding-btn:focus {
outline: none;
}
summary {
display: list-item;
}
details > summary > p:only-child {
display: inline;
}
pre code {
padding: 0;
}
</style>
<style type="text/css">
.dropdown-submenu {
position: relative;
}
.dropdown-submenu>.dropdown-menu {
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display: block;
content: " ";
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border-left-color: #cccccc;
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}
</style>
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// manage active state of menu based on current page
$(document).ready(function () {
// active menu anchor
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href = href.substr(href.lastIndexOf('/') + 1)
if (href === "")
href = "index.html";
var menuAnchor = $('a[href="' + href + '"]');
// mark the anchor link active (and if it's in a dropdown, also mark that active)
var dropdown = menuAnchor.closest('li.dropdown');
if (window.bootstrap) { // Bootstrap 4+
menuAnchor.addClass('active');
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} else { // Bootstrap 3
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// Navbar adjustments
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var style = document.createElement('style');
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// offset scroll position for anchor links (for fixed navbar)
for (var i = 1; i <= 6; i++) {
css += ".section h" + i + "{ " + pt + mt + "}\n";
}
style.innerHTML = "body {" + pt + "padding-bottom: 40px; }\n" + css;
document.head.appendChild(style);
});
</script>
<!-- tabsets -->
<style type="text/css">
.tabset-dropdown > .nav-tabs {
display: inline-table;
max-height: 500px;
min-height: 44px;
overflow-y: auto;
border: 1px solid #ddd;
border-radius: 4px;
}
.tabset-dropdown > .nav-tabs > li.active:before, .tabset-dropdown > .nav-tabs.nav-tabs-open:before {
content: "\e259";
font-family: 'Glyphicons Halflings';
display: inline-block;
padding: 10px;
border-right: 1px solid #ddd;
}
.tabset-dropdown > .nav-tabs.nav-tabs-open > li.active:before {
content: "\e258";
font-family: 'Glyphicons Halflings';
border: none;
}
.tabset-dropdown > .nav-tabs > li.active {
display: block;
}
.tabset-dropdown > .nav-tabs > li > a,
.tabset-dropdown > .nav-tabs > li > a:focus,
.tabset-dropdown > .nav-tabs > li > a:hover {
border: none;
display: inline-block;
border-radius: 4px;
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.tabset-dropdown > .nav-tabs.nav-tabs-open > li {
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.tabset-dropdown > .nav-tabs > li {
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</style>
<!-- code folding -->
<style type="text/css">
#TOC {
margin: 25px 0px 20px 0px;
}
@media (max-width: 768px) {
#TOC {
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@media print {
.toc-content {
/* see https://github.com/w3c/csswg-drafts/issues/4434 */
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}
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padding-right: 40px;
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</style>
</head>
<body>
<div class="container-fluid main-container">
<!-- setup 3col/9col grid for toc_float and main content -->
<div class="row">
<div class="col-xs-12 col-sm-4 col-md-3">
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</div>
</div>
<div class="toc-content col-xs-12 col-sm-8 col-md-9">
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<a href="data.html">Available dataset</a>
</li>
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</ul>
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</li>
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</a>
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</ul>
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</div><!--/.navbar -->
<div id="header">
<h1 class="title toc-ignore">Importation de données dans RStudio</h1>
</div>
<div id="but" class="section level2">
<h2>But</h2>
<p>Ce document est un aide-mémoire pour réussir l’importation des
données dans R. En suivant les différentes étapes, tout devrait bien se
passer.</p>
<p>L’objectif sera donc ici d’importer le jeu de données stockés dans le
fichier Excel <a href="datasets/samares_small.xlsx">samares</a>
disponible sur la page des <a href="data.html">données</a></p>
</div>
<div id="etape-1.-créer-un-projet" class="section level2">
<h2>Etape 1. Créer un projet</h2>
<p>Rstudio proposer d’organiser son travail en projet. Le projet permet
de faciliter l’accès aux différents fichiers d’un même projet. Pour
créer un projet il suffit d’aller en haut à droite, dans Project comme
dans la capture d’écran ci-dessous.</p>
<p><img src="img/h_creer_nouveau_projet.png"
style="width:80.0%" /> </p>
<p>On choisit de créer le projet depuis un nouveau répertoire</p>
<p><img src="img/h_nouveau_repertoire.png" style="width:80.0%" /></p>
<p>et de faire un projet standard</p>
<p><img src="img/h_nouveau_projet.png" style="width:80.0%" /> </p>
<p>qui s’appelera Td_Stat_1 et sera placé dans le répertoire désigné</p>
<p><img src="img/h_nom_projet.png" style="width:80.0%" /> </p>
</div>
<div id="etape-2.-créer-un-script" class="section level2">
<h2>Etape 2. Créer un script</h2>
<p>Les instructions dans R sont écrites dans un fichier de script. Ce
fichier permet de garder trace de toute l’analyse que vous mettrez en
oeuvre.</p>
<p>On ouvre donc un nouveau script <strong>File -> New File ->
Rscript</strong>. En haut du script, on indique la date, et le but de
l’analyse en faisant précéder les débuts de lignes par des
<code>#</code>.</p>
<div class="sourceCode" id="cb1"><pre class="sourceCode r"><code class="sourceCode r"><span id="cb1-1"><a href="#cb1-1" tabindex="-1"></a><span class="do">## le 19 septembre 2019 </span></span>
<span id="cb1-2"><a href="#cb1-2" tabindex="-1"></a><span class="do">## Tutoriel pour apprendre à importer un fichier de données dans R</span></span></code></pre></div>
<p>Les lignes qui commencent par <code>#</code> ne sont pas interprétées
par R, elles permettent de faire des commentaires.</p>
</div>
<div id="etape-3.-télécharger-le-fichier" class="section level2">
<h2>Etape 3. Télécharger le fichier</h2>
<p>Le fichier est disponible sur la page des <a href="data.html">jeux de
données</a></p>
<p>On peut le sauvegarder sur le disque en faisant un clic droit et en
choisissant ‘Save as’ ( ou ‘Sauvegarder la cible du lien sous’ ou tout
autre formulation similaire). On choisit de le sauver dans le répertoire
du projet qu’on vient de créer précédemment.</p>
</div>
<div id="etape-4.-dun-format-propriétaire-à-un-format-texte"
class="section level2">
<h2>Etape 4. D’un format propriétaire à un format texte</h2>
<p>Le format Excel est complexe et varie d’une plateforme à l’autre,
d’une langue à l’autre …. Pour éviter les surprises, il est préférable
d’exporter son fichier au format <code>csv</code>. Dans Excel, il suffit
d’aller dans le menu File puis Save as et de choisir l’extension csv
dans le menu déroulant des types de fichier puis de le sauver dans le
répertoire du projet sous le nom <code>samares_small.csv</code>. On a
donc un fichier <code>samares_small.csv</code> dans le répertoire du
projet.</p>
</div>
<div id="etape-5.-comprendre-le-format-du-fichier-de-données"
class="section level2">
<h2>Etape 5. Comprendre le format du fichier de données</h2>
<p>En ouvrant le fichier `samares_small.csv’ avec un éditeur de texte
(Notepad++ sous Windows, gedit sous Linux, TextWrangler sous Mac OS par
exemple), on peut voir le fichier brut et le début doit ressembler à
:</p>
<div class="sourceCode" id="cb2"><pre class="sourceCode r"><code class="sourceCode r"><span id="cb2-1"><a href="#cb2-1" tabindex="-1"></a>Etude d’une potentielle sélection génétique sur les capacités de dispersion du frêne,,,,,,,,,,</span>
<span id="cb2-2"><a href="#cb2-2" tabindex="-1"></a>Données partielles,,,,,,,,,,</span>
<span id="cb2-3"><a href="#cb2-3" tabindex="-1"></a>Source <span class="sc">:</span> perdue ,,,,,,,,,,</span>
<span id="cb2-4"><a href="#cb2-4" tabindex="-1"></a>Site,NomSite,Distance,Arbre,Poids,Surface,Largeur,Longueur,CircArbre,dispersion,log_disp</span>
<span id="cb2-5"><a href="#cb2-5" tabindex="-1"></a><span class="dv">1</span>,Grenou_1,<span class="dv">0</span>,<span class="dv">1</span>,<span class="fl">16.8</span>,<span class="fl">0.83907</span>,<span class="fl">0.45758</span>,<span class="fl">2.46212</span>,<span class="dv">57</span>,<span class="fl">0.049944642857143</span>,<span class="sc">-</span><span class="fl">2.99684002974653</span></span>
<span id="cb2-6"><a href="#cb2-6" tabindex="-1"></a><span class="dv">1</span>,Grenou_1,<span class="dv">0</span>,<span class="dv">1</span>,<span class="fl">25.4</span>,<span class="fl">0.80864</span>,<span class="fl">0.43251</span>,<span class="fl">2.47986</span>,<span class="dv">57</span>,<span class="fl">0.031836220472441</span>,<span class="sc">-</span><span class="fl">3.4471506288068</span></span>
<span id="cb2-7"><a href="#cb2-7" tabindex="-1"></a><span class="dv">1</span>,Grenou_1,<span class="dv">0</span>,<span class="dv">1</span>,<span class="fl">21.7</span>,<span class="fl">0.77436</span>,<span class="fl">0.44081</span>,<span class="fl">2.35872</span>,<span class="dv">57</span>,<span class="fl">0.035684792626728</span>,<span class="sc">-</span><span class="fl">3.3330306577928</span></span>
<span id="cb2-8"><a href="#cb2-8" tabindex="-1"></a><span class="dv">1</span>,Grenou_1,<span class="dv">0</span>,<span class="dv">1</span>,<span class="fl">14.9</span>,<span class="fl">0.86005</span>,<span class="fl">0.45292</span>,<span class="fl">2.63522</span>,<span class="dv">57</span>,<span class="fl">0.057721476510067</span>,<span class="sc">-</span><span class="fl">2.85212596484115</span></span>
<span id="cb2-9"><a href="#cb2-9" tabindex="-1"></a><span class="dv">1</span>,Grenou_1,<span class="dv">0</span>,<span class="dv">1</span>,<span class="dv">21</span>,<span class="fl">0.81353</span>,<span class="fl">0.46885</span>,<span class="fl">2.41978</span>,<span class="dv">57</span>,<span class="fl">0.038739523809524</span>,<span class="sc">-</span><span class="fl">3.25089491303743</span></span>
<span id="cb2-10"><a href="#cb2-10" tabindex="-1"></a><span class="dv">1</span>,Grenou_1,<span class="dv">0</span>,<span class="dv">1</span>,<span class="fl">20.1</span>,<span class="fl">0.82752</span>,<span class="fl">0.46522</span>,<span class="fl">2.40977</span>,<span class="dv">57</span>,<span class="fl">0.041170149253731</span>,<span class="sc">-</span><span class="fl">3.19004181790373</span></span>
<span id="cb2-11"><a href="#cb2-11" tabindex="-1"></a><span class="dv">1</span>,Grenou_1,<span class="dv">0</span>,<span class="dv">1</span>,<span class="fl">26.8</span>,<span class="fl">0.98631</span>,<span class="fl">0.48447</span>,<span class="fl">2.68182</span>,<span class="dv">57</span>,<span class="fl">0.036802611940299</span>,<span class="sc">-</span><span class="fl">3.30218645968743</span></span>
<span id="cb2-12"><a href="#cb2-12" tabindex="-1"></a><span class="dv">1</span>,Grenou_1,<span class="dv">0</span>,<span class="dv">1</span>,<span class="fl">21.4</span>,<span class="fl">0.87054</span>,<span class="fl">0.45428</span>,<span class="fl">2.71523</span>,<span class="dv">57</span>,<span class="fl">0.040679439252337</span>,<span class="sc">-</span><span class="fl">3.20203249225429</span></span>
<span id="cb2-13"><a href="#cb2-13" tabindex="-1"></a><span class="dv">1</span>,Grenou_1,<span class="dv">0</span>,<span class="dv">1</span>,<span class="fl">18.9</span>,<span class="fl">0.83487</span>,<span class="fl">0.42868</span>,<span class="fl">2.7107</span>,<span class="dv">57</span>,<span class="fl">0.044173015873016</span>,<span class="sc">-</span><span class="fl">3.11964117694036</span></span></code></pre></div>
<p>Le fichier est construit de la manière suivante</p>
<ul>
<li>3 lignes de commentaires,</li>
<li>une ligne qui indique le nom des colonnes, puis les données
elles-mêmes</li>
<li>le changement de colonnes est matérialisé par une virgule.</li>
</ul>
<p>Nous allons donc expliquer ceci à R.</p>
</div>
<div id="etape-6-importation-dans-r" class="section level2">
<h2>Etape 6 : Importation dans R</h2>
<div class="sourceCode" id="cb3"><pre class="sourceCode r"><code class="sourceCode r"><span id="cb3-1"><a href="#cb3-1" tabindex="-1"></a>dta <span class="ot"><-</span> <span class="fu">read.table</span>(<span class="at">file =</span> <span class="st">'samares_small.csv'</span>, <span class="do">## le nom du fichier qu'on souhaite lire</span></span>
<span id="cb3-2"><a href="#cb3-2" tabindex="-1"></a> <span class="at">skip =</span> <span class="dv">3</span>, <span class="do">## pour dire à R d'ignorer les 3 premières lignes de commentaires</span></span>
<span id="cb3-3"><a href="#cb3-3" tabindex="-1"></a> <span class="at">header =</span> <span class="cn">TRUE</span>, <span class="do">## pour indiquer que les colonnes ont un nom </span></span>
<span id="cb3-4"><a href="#cb3-4" tabindex="-1"></a> <span class="at">sep =</span> <span class="st">','</span> <span class="do">## pour indiquer que le séparateur de colonnes est une virgule</span></span>
<span id="cb3-5"><a href="#cb3-5" tabindex="-1"></a> ) </span></code></pre></div>
<p>Normalement R n’indique aucune erreur.</p>
<p><strong>On n’oublie pas de sauver régulièrement le
script.</strong></p>
</div>
<div id="etape-7.-vérifier-limportation" class="section level2">
<h2>Etape 7. Vérifier l’importation</h2>
<p>On doit voir apparaître dans l’onglet environnement un nouveau jeu de
données <code>dta</code>. Il est indiqué qu’il a 120 observations
(i.e. 120 lignes dans le jeu de données) et 11 variables (11 colonnes
dans le jeu de données).</p>
<p>On peut faire afficher les premières lignes pour vérifier qu’elles
sont correctes</p>
<div class="sourceCode" id="cb4"><pre class="sourceCode r"><code class="sourceCode r"><span id="cb4-1"><a href="#cb4-1" tabindex="-1"></a><span class="fu">head</span>(dta)</span></code></pre></div>
<pre><code>## Site NomSite Distance Arbre Poids Surface Largeur Longueur CircArbre
## 1 1 Grenou_1 0 1 16.8 0.83907 0.45758 2.46212 57
## 2 1 Grenou_1 0 1 25.4 0.80864 0.43251 2.47986 57
## 3 1 Grenou_1 0 1 21.7 0.77436 0.44081 2.35872 57
## 4 1 Grenou_1 0 1 14.9 0.86005 0.45292 2.63522 57
## 5 1 Grenou_1 0 1 21.0 0.81353 0.46885 2.41978 57
## 6 1 Grenou_1 0 1 20.1 0.82752 0.46522 2.40977 57
## dispersion log_disp
## 1 0.04994464 -2.996840
## 2 0.03183622 -3.447151
## 3 0.03568479 -3.333031
## 4 0.05772148 -2.852126
## 5 0.03873952 -3.250895
## 6 0.04117015 -3.190042</code></pre>
<p>ou les dernières</p>
<div class="sourceCode" id="cb6"><pre class="sourceCode r"><code class="sourceCode r"><span id="cb6-1"><a href="#cb6-1" tabindex="-1"></a><span class="fu">tail</span>(dta)</span></code></pre></div>
<pre><code>## Site NomSite Distance Arbre Poids Surface Largeur Longueur CircArbre
## 115 2 Grenou_2 0.2 3 29.4 0.80117 0.43407 2.59293 22
## 116 2 Grenou_2 0.2 3 21.9 0.72918 0.39925 2.43788 22
## 117 2 Grenou_2 0.2 3 29.5 1.02212 0.46271 2.99618 22
## 118 2 Grenou_2 0.2 3 29.0 0.68639 0.39900 2.39071 22
## 119 2 Grenou_2 0.2 3 27.8 0.77729 0.43905 2.57643 22
## 120 2 Grenou_2 0.2 3 27.5 0.83004 0.45817 2.62109 22
## dispersion log_disp
## 115 0.02725068 -3.602677
## 116 0.03329589 -3.402321
## 117 0.03464814 -3.362511
## 118 0.02366862 -3.743605
## 119 0.02796007 -3.576978
## 120 0.03018327 -3.500467</code></pre>
<p>On peut aussi demander un résumé du jeu de données qui va nous aider
à vérifier que l’importation s’est bien déroulée.</p>
<div class="sourceCode" id="cb8"><pre class="sourceCode r"><code class="sourceCode r"><span id="cb8-1"><a href="#cb8-1" tabindex="-1"></a><span class="fu">summary</span>(dta)</span></code></pre></div>
<pre><code>## Site NomSite Distance Arbre Poids
## Min. :1.0 Length:120 Min. :0.0 Min. :1 Min. :13.80
## 1st Qu.:1.0 Class :character 1st Qu.:0.0 1st Qu.:1 1st Qu.:21.18
## Median :1.5 Mode :character Median :0.1 Median :2 Median :24.55
## Mean :1.5 Mean :0.1 Mean :2 Mean :25.44
## 3rd Qu.:2.0 3rd Qu.:0.2 3rd Qu.:3 3rd Qu.:29.00
## Max. :2.0 Max. :0.2 Max. :3 Max. :54.70
## Surface Largeur Longueur CircArbre
## Min. :0.6289 Min. :0.3613 Min. :1.782 Min. :22.00
## 1st Qu.:0.8071 1st Qu.:0.4259 1st Qu.:2.418 1st Qu.:28.00
## Median :0.8709 Median :0.4588 Median :2.596 Median :32.00
## Mean :0.9078 Mean :0.4809 Mean :2.575 Mean :39.75
## 3rd Qu.:0.9884 3rd Qu.:0.5379 3rd Qu.:2.711 3rd Qu.:57.00
## Max. :1.4495 Max. :0.7027 Max. :3.123 Max. :67.50
## dispersion log_disp
## Min. :0.02262 Min. :-3.789
## 1st Qu.:0.03016 1st Qu.:-3.501
## Median :0.03475 Median :-3.360
## Mean :0.03761 Mean :-3.317
## 3rd Qu.:0.04118 3rd Qu.:-3.190
## Max. :0.08671 Max. :-2.445</code></pre>
<p>Normalement Les variables quantitatives sont résumées
quantitativement par le minimum, le premier quartile, la médiane, etc ….
Tandis que les variables qualitatives sont interprétées comme des
facteurs et sont résumées par le nombre d’occurences de chaque niveau du
facteur.</p>
<p>Si toutes les vérifications sont correctes, votre jeu de données est
prêt à être analysé.</p>
</div>
<div id="etape-8.-quand-ça-va-mal" class="section level2">
<h2>Etape 8. Quand ça va mal</h2>
<div id="sil-ny-a-pas-de-noms-de-colonnes-dans-le-fichier"
class="section level3">
<h3>S’il n’y a pas de noms de colonnes dans le fichier</h3>
<p>Il suffit d’indiquer <code>header = FALSE</code>, dans ce cas les
colonnes seront nommées <code>V1</code>, <code>V2</code>, etc</p>
</div>
<div id="les-différents-types-de-séparateurs" class="section level3">
<h3>Les différents types de séparateurs</h3>
<p>Si le séparateur de colonnes n’est pas la <code>,</code>, alors il
faut modifier l’argument <code>sep</code></p>
<table>
<thead>
<tr class="header">
<th align="center">Séparateur dans le fichier</th>
<th align="center">argument à passer</th>
</tr>
</thead>
<tbody>
<tr class="odd">
<td align="center">,</td>
<td align="center"><code>sep = ','</code></td>
</tr>
<tr class="even">
<td align="center">;</td>
<td align="center"><code>sep = ';'</code></td>
</tr>
<tr class="odd">
<td align="center">espace</td>
<td align="center"><code>sep = ' '</code></td>
</tr>
<tr class="even">
<td align="center">tab</td>
<td align="center"><code>sep = '\t'</code></td>
</tr>
</tbody>
</table>
</div>
<div id="problème-possible-avec-les-variables-numériques"
class="section level3">
<h3>Problème possible avec les variables numériques</h3>
<p>Il est possible avec une version française d’Excel, que le symbole
qui code pour la décimale ne soit pas le <code>.</code> qui est la
convention internationale mais le <code>,</code> qui est l’habitude
Française. Si on ne l’indique pas à R, il ne va pas comprendre que la
variable concernée est quantitative. Ceci sera visible dans le résumé de
la variable. Si tel est le cas, il suffit de rajouter l’argument
<code>dec = ','</code> dans la fonction <code>read.table</code> (à
n’importe quel endroit ).</p>
<div class="sourceCode" id="cb10"><pre class="sourceCode r"><code class="sourceCode r"><span id="cb10-1"><a href="#cb10-1" tabindex="-1"></a>dta_wrong <span class="ot"><-</span> <span class="fu">read.table</span>(<span class="at">file =</span> <span class="st">'samares_small.csv'</span>, <span class="do">## le nom du fichier qu'on souhaiote lire</span></span>
<span id="cb10-2"><a href="#cb10-2" tabindex="-1"></a> <span class="at">skip =</span> <span class="dv">3</span>, <span class="do">## pour dire à R d'ignorer les 3 premières lignes de commentaires</span></span>
<span id="cb10-3"><a href="#cb10-3" tabindex="-1"></a> <span class="at">header =</span> <span class="cn">TRUE</span>, <span class="do">## pour indiquer que les colonnes ont un nom </span></span>
<span id="cb10-4"><a href="#cb10-4" tabindex="-1"></a> <span class="at">sep =</span> <span class="st">','</span>, <span class="do">## pour indiquer que le séparateur de colonnes est une virgule</span></span>
<span id="cb10-5"><a href="#cb10-5" tabindex="-1"></a> <span class="at">dec =</span> <span class="st">','</span></span>
<span id="cb10-6"><a href="#cb10-6" tabindex="-1"></a> ) </span></code></pre></div>
<p>Ici, puisque le signe de décimal était un point <code>.</code> mais
qu’on lui indique le contraire, on reprère justement un problème
lorsqu’on demande un résumé des données.</p>
<div class="sourceCode" id="cb11"><pre class="sourceCode r"><code class="sourceCode r"><span id="cb11-1"><a href="#cb11-1" tabindex="-1"></a><span class="fu">summary</span>(dta_wrong)</span></code></pre></div>
<pre><code>## Site NomSite Distance Arbre
## Min. :1.0 Length:120 Length:120 Min. :1
## 1st Qu.:1.0 Class :character Class :character 1st Qu.:1
## Median :1.5 Mode :character Mode :character Median :2
## Mean :1.5 Mean :2
## 3rd Qu.:2.0 3rd Qu.:3
## Max. :2.0 Max. :3
## Poids Surface Largeur Longueur
## Length:120 Length:120 Length:120 Length:120
## Class :character Class :character Class :character Class :character
## Mode :character Mode :character Mode :character Mode :character
##
##
##
## CircArbre dispersion log_disp
## Length:120 Length:120 Length:120
## Class :character Class :character Class :character
## Mode :character Mode :character Mode :character
##
##
## </code></pre>
</div>
<div id="une-colonne-pour-indiquer-les-noms-des-lignes"
class="section level3">
<h3>Une colonne pour indiquer les noms des lignes</h3>
<p>Si un identifiant est présent pour chaque ligne, on ajoute dans la
commande <code>read.table</code> l’argument <code>row.names=1</code>
pour indiquer que la première colonne sert à nommer les lignes.</p>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
<script>
// add bootstrap table styles to pandoc tables
function bootstrapStylePandocTables() {
$('tr.odd').parent('tbody').parent('table').addClass('table table-condensed');
}
$(document).ready(function () {
bootstrapStylePandocTables();
});
</script>
<!-- tabsets -->
<script>
$(document).ready(function () {
window.buildTabsets("TOC");
});
$(document).ready(function () {
$('.tabset-dropdown > .nav-tabs > li').click(function () {
$(this).parent().toggleClass('nav-tabs-open');
});
});
</script>
<!-- code folding -->
<script>
$(document).ready(function () {
// temporarily add toc-ignore selector to headers for the consistency with Pandoc
$('.unlisted.unnumbered').addClass('toc-ignore')
// move toc-ignore selectors from section div to header
$('div.section.toc-ignore')
.removeClass('toc-ignore')
.children('h1,h2,h3,h4,h5').addClass('toc-ignore');
// establish options
var options = {
selectors: "h1,h2,h3",
theme: "bootstrap3",
context: '.toc-content',
hashGenerator: function (text) {
return text.replace(/[.\\/?&!#<>]/g, '').replace(/\s/g, '_');
},
ignoreSelector: ".toc-ignore",
scrollTo: 0
};
options.showAndHide = true;
options.smoothScroll = true;
// tocify
var toc = $("#TOC").tocify(options).data("toc-tocify");
});
</script>
<!-- dynamically load mathjax for compatibility with self-contained -->
<script>
(function () {
var script = document.createElement("script");
script.type = "text/javascript";
script.src = "https://mathjax.rstudio.com/latest/MathJax.js?config=TeX-AMS-MML_HTMLorMML";
document.getElementsByTagName("head")[0].appendChild(script);
})();
</script>
</body>
</html>