From b55391c4da16844e3d178890933b3cceee81f194 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Damion Dooley Date: Thu, 28 Mar 2024 11:13:54 -0700 Subject: [PATCH] funicle parent adustment And getting rid of temporary NCBITaxon terms due to Ontofox outage. --- src/ontology/foodon-edit.ofn | 130 +++++++---------------------------- 1 file changed, 23 insertions(+), 107 deletions(-) diff --git a/src/ontology/foodon-edit.ofn b/src/ontology/foodon-edit.ofn index 7995a3e0..32e3eee7 100644 --- a/src/ontology/foodon-edit.ofn +++ b/src/ontology/foodon-edit.ofn @@ -9147,7 +9147,6 @@ Declaration(Class(obo:NCBITaxon_205481)) Declaration(Class(obo:NCBITaxon_205524)) Declaration(Class(obo:NCBITaxon_205567)) Declaration(Class(obo:NCBITaxon_205582)) -Declaration(Class(obo:NCBITaxon_206130)) Declaration(Class(obo:NCBITaxon_206147)) Declaration(Class(obo:NCBITaxon_209541)) Declaration(Class(obo:NCBITaxon_210060)) @@ -9240,6 +9239,7 @@ Declaration(Class(obo:NCBITaxon_251531)) Declaration(Class(obo:NCBITaxon_251532)) Declaration(Class(obo:NCBITaxon_255560)) Declaration(Class(obo:NCBITaxon_256424)) +Declaration(Class(obo:NCBITaxon_2576622)) Declaration(Class(obo:NCBITaxon_257723)) Declaration(Class(obo:NCBITaxon_258209)) Declaration(Class(obo:NCBITaxon_259381)) @@ -70126,13 +70126,6 @@ AnnotationAssertion(go:hasExactSynonym obo:NCBITaxon_112509 "hordeum distichum") AnnotationAssertion(go:hasExactSynonym obo:NCBITaxon_112509 "hordeum vulgare l. convar. distichon") SubClassOf(obo:NCBITaxon_112509 obo:NCBITaxon_4513) -# Class: obo:NCBITaxon_1125938 (Selenicereus costaricensis) - -AnnotationAssertion(dcterms:contributor obo:NCBITaxon_1125938 ) -AnnotationAssertion(dcterms:date obo:NCBITaxon_1125938 "2024-03-23T03:45:55Z"^^xsd:dateTime) -AnnotationAssertion(rdfs:label obo:NCBITaxon_1125938 "Selenicereus costaricensis"@en) -SubClassOf(obo:NCBITaxon_1125938 obo:OBI_0100026) - # Class: obo:NCBITaxon_112728 (Polyprion americanus) AnnotationAssertion(obo:IAO_0000114 obo:NCBITaxon_112728 obo:IAO_0000428) @@ -74758,18 +74751,6 @@ AnnotationAssertion(go:hasNarrowSynonym obo:NCBITaxon_190224 "Rubus flagellaris AnnotationAssertion(go:hasSynonym obo:NCBITaxon_190224 "rubus flagellaris"@en) SubClassOf(obo:NCBITaxon_190224 obo:FOODON_03414206) -# Class: obo:NCBITaxon_190531 (Vaccinium deliciosum) - -AnnotationAssertion(rdfs:label obo:NCBITaxon_190531 "Vaccinium deliciosum"@en) -SubClassOf(obo:NCBITaxon_190531 obo:OBI_0100026) - -# Class: obo:NCBITaxon_190542 (Vaccinium membranaceum) - -AnnotationAssertion(dcterms:contributor obo:NCBITaxon_190542 ) -AnnotationAssertion(dcterms:date obo:NCBITaxon_190542 "2024-03-23T03:09:40Z"^^xsd:dateTime) -AnnotationAssertion(rdfs:label obo:NCBITaxon_190542 "Vaccinium membranaceum"@en) -SubClassOf(obo:NCBITaxon_190542 obo:OBI_0100026) - # Class: obo:NCBITaxon_190544 (Vaccinium ovalifolium) AnnotationAssertion(obo:IAO_0000114 obo:NCBITaxon_190544 obo:IAO_0000122) @@ -74903,13 +74884,6 @@ AnnotationAssertion(go:hasSynonym obo:NCBITaxon_192602 "inca scad"@en) AnnotationAssertion(go:hasSynonym obo:NCBITaxon_192602 "trachurus murphyi"@en) SubClassOf(obo:NCBITaxon_192602 obo:FOODON_03411090) -# Class: obo:NCBITaxon_193297 (Aronia) - -AnnotationAssertion(dcterms:contributor obo:NCBITaxon_193297 ) -AnnotationAssertion(dcterms:date obo:NCBITaxon_193297 "2024-03-23T03:07:03Z"^^xsd:dateTime) -AnnotationAssertion(rdfs:label obo:NCBITaxon_193297 "Aronia"@en) -SubClassOf(obo:NCBITaxon_193297 obo:OBI_0100026) - # Class: obo:NCBITaxon_193309 (Pyracantha coccinea) AnnotationAssertion(obo:IAO_0000114 obo:NCBITaxon_193309 obo:IAO_0000428) @@ -75852,24 +75826,6 @@ AnnotationAssertion(go:hasSynonym obo:NCBITaxon_205582 "litchi tomato"@en) AnnotationAssertion(go:hasSynonym obo:NCBITaxon_205582 "solanum sisymbriifolium"@en) SubClassOf(obo:NCBITaxon_205582 obo:FOODON_03415104) -# Class: obo:NCBITaxon_206130 (obo:NCBITaxon_206130) - -AnnotationAssertion(obo:IAO_0000114 obo:NCBITaxon_206130 obo:IAO_0000428) -AnnotationAssertion(obo:IAO_0000115 obo:NCBITaxon_206130 "The tub gurnard, *Chelidonichthys lucerna* (also C. lucernus, Trigla lucerna, T. corax) is a species of bottom-dwelling coastal fish with a spiny armored head and fingerlike pectoral fins used for crawling along the sea bottom. 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