diff --git a/R/internal.R b/R/internal.R new file mode 100644 index 0000000..5335701 --- /dev/null +++ b/R/internal.R @@ -0,0 +1,49 @@ +#' @importFrom BiocGenerics relist +#' @importFrom data.table as.data.table melt.data.table +#' @importFrom doParallel registerDoParallel +#' @importFrom doRNG %dorng% +#' @importFrom EnvStats ebeta +#' @importFrom ExtDist eBeta pBeta +#' @importFrom foreach foreach +#' @importFrom gamlss gamlss gamlss.control +#' @importFrom gamlss.dist pBEINF +#' @importFrom GenomicRanges mcols `mcols<-` granges reduce findOverlaps +#' @importFrom IRanges subsetByOverlaps +#' @importFrom matrixStats rowMedians rowIQRs +#' @importFrom methods as is +#' @importFrom parallel detectCores makeCluster stopCluster +#' @importFrom S4Vectors queryHits +#' @importFrom stats median na.omit rbeta pbeta +#' @importFrom utils head tail +## #' @importFrom Rcpp sourceCpp +## #' @useDynLib ramr, .registration=TRUE + + +# internal globals, constants and helper functions +# + +################################################################################ +# Globals, unload +################################################################################ + +utils::globalVariables(c( + "chunk", "column", "ncpg", "width", "..data.samples", ":=", "alpha", "color", + "size", "start" +)) + +# .onUnload <- function (libpath) {library.dynam.unload("ramr", libpath)} + +################################################################################ +# Constants +################################################################################ + +# descr: ... + +# + +################################################################################ +# Functions: ... +################################################################################ + +# descr: ... +# value: ...