Praktični deo master rada

Tema: Utvrđivanje N-glikozilovanosti proteina metodama mašinskog učenja

Master studije

Autor:

Aleksandar Anžel 1025/2018

Problem:

Problem koji se rešava je utvrđivanje N-vezane glikozilovanosti proteina pomoću metoda potpornih vektora i potpuno povezanih neuronskih mreža, na osnovu kreiranih fizičko-hemijskih svojstava. Korišćen skup podataka sadrži nebalansiranost klasa, te se koriste različite tehnike za prevazilaženje tog problema.

Pokretanje jupyter-notebook datoteka:

Datoteke su u potpunosti prilagođene pokretanju unutar Google Colaboratory okruženja.

Podaci:

Informacije o korišćenim podacima su prisutne unutar Main_1.ipynb datoteke, kao i unutar Master_rad.pdf datoteke.
Podaci koji predstavljaju ulaze modela mašinskog učenja se generišu na osnovu postupka opisanog u Master_rad.pdf datoteci.
Intenzivno se koriste Biopython, SciKit-Learn, Keras, Numpy, Pandas, Matplotlib i ostale srodne biblioteke.